라이츄 과학츄

|  일단 큰 틀은 생물학(그냥 본인 전공 관련해서), 과학을 벗어나지는 않습니다.

2018.03.11 02:05

15. bp와 Da츄

조회 수 438 추천 수 2 댓글 0
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ㅇㅅㅇ/ 

던파 만렙 찍었져 희희 




오늘 알아볼 것은 bp와 Da입니다. 베이스페어와 달톤인데 이거 일단 단위예요. 그럼 뭔 단위? 베이스페어는 DNA 길이 단위이고, 달톤은 분자량인데 생물학쪽에서는 단백질 크기 달 때 많이 씁니다. 


1. bp

DNA는 ATGC 네 개의 염기로 이루어져 있고, RNA의 경우 티민 대신 우라실이 들어 있습니다. 다만 RNA를 전기영동 할 일은 별로 없는게 쟤는 진짜 레알 쿠크다스보다 더 잘 부서져서 잘못하면 똥망이라....... 커버글래스보다 더 조심스럽게 다뤄야 합니다. 커버글래스는 완충제 대면 되지만 쟤는 답이 없어요. RNAse를 아작내지 않는 이상... 


그럼 베이스페어는 뭐죠? 라고 한다면 시퀀스를 이루고 있는 염기 수를 말합니다. 예를 들어서 20bp이면 저 네 개의 염기 중 20개가 시퀀스를 이루고 있는 거고, 100bp면 100개의 염기가 있는 거고요. 1kb는 염기 1000개예요. (k=kilo) 더 멀리 나가면 Mbp도 있는게 거까지 볼 일은 잘 없습니다. 사람 염색체까지 간다면 몰라... 3_3 사람 염색체는 엄청난 수의 염기로 이루어져 있어서 인트론 포함하는 시퀀스를 복사+붙여넣기 하다가는 슈퍼컴퓨터 아닌 이상 렉이 극심해지거든요. 유전자 자체가 염기 몇백만개? 이 정도이니... (그리고 염색체 안에는 그런 유전자가 아주 여러 개가 내장되어 있습니다) 


이게 전기 영동을 했을 떄의 사진입니다. 웰은 네 개가 있네요. ㅇㅅㅇ 그림을 보시면 오른쪽에 뭔 작대기가 겁나 많이 있는데, 이게 래더라는 겁니다. 쉽게 말하자면 '자'의 역할을 하는 건데, 래더에는 특정한 염기 수를 갖는 DNA와 dye(전기영동 시 어디까지 내려갔나 보기 쉽게 섞어주는 용도)가 섞여 있습니다. 종류에 따라서 들어있는 DNA의 bp 수는 다릅니다. 최대 10kb까지도 있고, 최소 100bp도 있습니다. 몇십bp짜리도 있죠. 자의 역할이라고 했는데 저게 어딜 봐서 자의 역할이냐? 라고 하신다면 


래더를 사면 저렇게 밴드별로 DNA의 크기가 얼마인지 적혀진 게 같이 옵니다. (가운데 놈이 래더인 듯 합니다) 저걸 보고 아는거죠. 예를 들어서 PCR을 했을 때 DNA가 900bp이면, 저 래더와 같이 내렸을 때 밴드가 1000bp~750bp 밴드 사이에 나오게 됩니다. (물론 1000bp에 더 가깝겠죠) 


2. Da(달톤)

엄밀히 말하자면 원자 질량 단위입니다. 설명을 보자면 [원자 질량 단위(한국 한자原子質量單位, unified atomic mass unit, 기호: u, Da)는 원자나 분자 따위의 질량 표준 단위이다(원자 질량). 1 원자 질량 단위는 대략 핵자 하나의 질량이고 수치적으로 1 g/mol과 동등하다.[3] 원자 질량 단위는 결합이 없고 핵과 전자바닥상태이며 정지질량일 때 {\displaystyle {\ce {^{12}_{6}C}}}원자 질량112로 정의되며 그 값은 1.660 539 040(20) × 10-27 킬로그램 또는 약 1.66 욕타그램이다.[4]국제 도량형 위원회는 원자 질량 단위를 국제 단위계로 사용할 수 있는 비국제단위로 분류하였다. (출처-위키백과)] 라고 하는데 이건 대체 뭔 소린지 저도 모르겠고요... 12C의 원자 질량이 아보가드로 수니까 저건 아보가드로 수의 12분의 1...인 거죠. 

(아보가드로 수: 분자량당 구성하고 있는 원자의 수. 어떤 분자건 간에 6.02214129(27)×1023 mol−1입니다)


참고로 사실 1달톤=1분자량(1그램/mol)입니다. 


그럼 이걸 같이 봅시다 허허 

사실 버퍼별로 다른데 저게 왜 다른지는 저도 모르겠습니다. 랩바랩이라 그런 건 아닌듯한데;; 여튼... 그렇습니다. 킬로가 붙었어요. 


단백질도 전기영동을 하는데, 그럴 때 DNA처럼 내리고자 하는 단백질이 똑띠 내려졌나 확인하기 위해 저게 필요합니다. 내리고자 하는 단백질이 몇키로달톤인가를 알아야 하죠. 물론 단백질에 단백질 붙어있으면 합산해야 하는 게 함정. GFP같이 자주 쓰는 단백질은 분자량이 나와있습니다. 루비스코나 항체같은 것도요. (항체 생각보다 분자량 쩝니다) 


단백질은 아미노산이 아주 줄줄이 사탕으로 엮여서 이야 합성이다 접자 접고 또 접자 한 다음에 당 붙여서 송장 붙이고 보냅니다. 분자량이 DNA를 '따위'로 만들어버릴 정도로 어마무시하게 크기 떄문에 달톤으로 표시하는 건 바이트 낭비고요, 고로 단백질은 킬로달톤을 씁니다. 항체 중 하나인 이뮤노글로불린 G가 분자량 150키로달톤입니다. (항체는 이뮤노글로불린 A, D, E, G, M이 있습니다) 달톤으로 하면...... 15만이네요. 어유. 놀라지 마요 이거 다 여러분들 몸에 있는거예요. 




요즘 일자리가 안 구해져서 알바라도 구해보자고 이력서를 올렸는데, 자꾸 쓸데 없는 연락이 와서 탈이네요. 

다음번에는 드디어!!!!!! 형질전환에 대해 알아봅시다...... 


라이츄 과학츄

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